La Agrupación de la Santa Agonía, Vera Cruz y Condena de Jesús fue fundada, en el seno de la Cofradía Marraja de Cartagena, en mayo de 1929, por un grupo de Hijos de María del Patronato del Sagrado Corazón de Jesús, a iniciativa de la superiora de aquel colegio, Sor María Mailhán.

Su incorporación a la procesión marraja del Santo Entierro, en la noche del Viernes Santo, tuvo lugar un año más tarde, acompañando a la imagen del Santísimo Cristo de la Agonía, una talla anónima que formaba parte de aquel cortejo desde finales del siglo XIX.

En 1959, al crearse la procesión del Sábado Santo, la Agrupación incorporó un nuevo tercio, el de la Vera Cruz, que es Titular de dicha procesión.

En 1982 creó un nuevo tercio, el de la Condena de Jesús, que desde 1984 forma parte de la procesión de la Calle de la Amargura o del Encuentro, en la madrugada del Viernes Santo.